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院士团队提供远程医疗服务利用信息化手段，为患者提供科学的就医流程，合理配置优势医疗资源，满足民众对医疗健康的需求。复旦大学附属华山医院由院士坐阵，注重诊疗与团队建设并举，通过互联网构建“技术水平更高、服务力度更大、覆盖范围更广”三位一体医疗服务公益网络，将医疗服务输送至全国各地，充分挖掘医疗资源潜力，让医疗服务方便可及。同时，华山医院通过指导和帮助基层医生诊治与治疗，带动区域医疗健康水平整体发展，探索建立一条具有特的医疗资源联网输送之路。发挥专科优势，建立院士工作站18家、皮肤科专科联盟181家、科专科联盟30家、影像专科联盟86家等特专科联盟，服务更广大患者人群；成立远程医学中心，提供远程医疗服务，解决中西部地区、老区和偏远地区患者“看专家难”问题；构建区域医联体，指导家庭医生掌握慢病的防治方法。
医院共设有45个临床学科和9个公共学科；现有国家教育部重点学科4个（血液病学、内分泌与代谢病学、心血管病学、神经病学）；国家临床重点专科项目22个和国家临床重点实验室1个（消化内科、麻醉科、重症医学科、临床护理、骨科、检验科、心血管内科、内分泌科、血液科、儿科消化、肾脏内科、皮肤科、神经内科、呼吸内科、急诊科、普外科、烧伤科、科、肿瘤中心、老年病科、放射影像、中医肿瘤、内分泌代谢病重点实验室）；目前也是国家中西医结合示范单位；上海市重点学科“重中之重”1个，上海市优势学科2个，上海市特学科1个，上海市重点学科2个，上海市教委及卫生重点学科6个。